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生醫文獻探勘技術(Biomedical Text Mining),能協助研究人員於巨量的生物醫學研究資料中擷取特定成果進行分析,完善的資料探勘系統更可省去使用者大量的時間,文獻探勘技術也從傳統的手寫規則式(rule-based)架構逐漸演進成機器學習(machine learning)以及類神經網路(artificial neural network),近期發表的BERT系統,更是在多個文獻探勘議題中有傑出的表現,在此研習課程中將針對BERT系統的概念以及原理進行基本講解,並帶領學員嘗試實機操作BERT應用於文獻探勘。歡迎有python實作經驗且對資料探勘有興趣的師生踴躍參加,活動詳情與線上報名:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20200106.php (公佈日期:2019-12-04)
   
生醫統計著重在因果關係的發現與探討,而AI機器學習則重視數學建模,提供預測分析與決策參考。本次所舉辦之研習會課程包括「 人工智慧數學建模與預測」( AI Mathematical Modeling and Prediction) 與「 智慧型演化學習平台 」(Intelligent Evolutionary Learning Platform) 兩大主題的介紹說明,平台的應用包含分析生醫數據、生醫影像、基因表現與數位金融等數據,可提供客戶數據建模分析和系統聯合開發的快速客製化研究服務。並輔以人工智慧醫療應用範例,歡迎對生醫資訊與大數據分析有興趣的研究人員踴躍參加。期望此研習會能提供相關領域研究的人員在數據分析上之助益,讓研究者於日後面對高維度生醫數據的建模預測分析,不再一籌莫展、無所適從。活動詳情與線上報名:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20191129.php (公佈日期:2019-11-27)
   
本核心特別邀請美國UCSC Genome Center團隊來台親自講授UCSC Xena(http://xena.ucsc.edu/),這是一個網絡介面的多體學視覺化探索工具,用於癌症多體學數據和相關臨床及表型註解資料分析。UCSC Xena (http://xena.ucsc.edu/) is a web-based visual integration and exploration tool for multi-omic data and associated clinical and phenotypic annotations. Xena showcases seminal cancer genomics datasets from TCGA, the Pan-Cancer Atlas, PCAWG, GDC, GTEx, ICGC, and more; a total of more than 1500 datasets across 50 cancer types. We support virtually every type of functional genomics data including positional mutation data, copy number variation, gene and exon expression, DNA methylation, and protein expression, as well as phenotype and clinical data such as age and subtype. 全程英文授課,報名對象以教師及研究學者為優先。歡迎有興趣的學員報名參加實機演練(可自備tsv或txt格式檔案),機會難得,敬請踴躍報名。活動詳情與線上報名:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20191205.php (公佈日期:2019-10-09)
   
Exome-Seq(外顯子組定序)集中在分析基因組的蛋白質編碼區,雖然只佔整個人類基因組的1%左右,卻涵蓋了將近85% 因遺傳變異而導致的人類疾病基因組區域。相對於全基因體定序而言,外顯子組定序的成本較低、省時且效率高,因此外顯子組定序在研究和臨床基因檢測服務早已具有舉足輕重的地位。本課程將利用本核心設施在NGS生物資訊分析豐富的經驗與所建置的分析平台,以實例解說實驗方法及分析流程,搭配電腦實地操作,一步一步引導學員如何利用公有資料庫的資源進行序列變異及基因體拷貝數變異分析。期望此研習會能提供相關領域研究的人員及學生在實驗數據分析上之助益,讓研究者於日後面對基因體數據分析,不再一籌莫展無所適從,歡迎對生物資訊分析有興趣的師生踴躍參加。活動詳情與線上報名:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20191107.php (公佈日期:2019-10-09)
   
大數據分析是當今及未來健康科學中最重要及最經常性的工作,為促進產、官、學界專家交流,增進大數據研發及產業發展,國家衛生研究院群體健康科學研究所與生醫資源中心、衛福部、科技部生技醫藥核心設施平台、衛福部衛生福利資料科學中心國家衛生研究院研究分中心以及ICSA-Taiwan Chapter合作,邀請國內外產官學相關領域學者專家,於健康科學大數據研討會發表最新發展,歡迎對大數據有興趣的研究同好踴躍參加!會議詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/big-data-conf-2018/wp/ (公佈日期:2018-05-28)
   
如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會,來提?炙耵威敺Л篘蝷妖u實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。亦將再次講解如何利用GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)所提供之友善且免費的使用者界面,進一步產出高通量數據的生物路徑層次之註解,也希望學員能夠以所學到的原理與觀念應用至其他感興趣的高通量資料,提供更有力的證據來支持生物醫學研究。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20180416.php (公佈日期:2018-03-28)
   
以Discovery Studio(DS)為基礎使用者除了熟習軟體功能及應用層面外,更能透過實機練習進一步學會處理各種小分子之理論模擬計算、分子Structure /ligand-based的策略和操作,並以分子結構為基礎之交互作用性預測功能(包含Docking, Pharmacophore等方法)。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20180314.php (公佈日期:2018-02-23)
   
為便利各地學者能就近參與生物資訊分析實務課程,此次研習會首度移師東岸,將在宜蘭大學舉辦,本研習會包括「次世代定序數據分析與應用」與「癌症基因體與大數據資料處理分析」等兩大主題,以簡明互動的授課方式,讓學員經由實機操作熟悉相關軟體、資料庫及數據處理的方法。期望此研習會能提供相關領域之研究學者及學生在實驗數據分析上之助益,歡?儮鴷耵姜穈T分析有興趣的師生踴躍參加。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20180222.php (公佈日期:2018-02-01)
   
PubMed是由美國的National Center for Biotechnology Information所開發,存放最多生醫文獻,也是生醫研究人員在研究過程中最依賴的資料庫,研究人員該如何從如此巨量的文獻資料中找到與自己研究相關的文獻,文獻的蒐集及分析是現在正面臨的一大問題。本核心針對文獻探勘技術的現況,設計一系列課程。此研習課程將依序介紹文獻探勘技術及分析方法應用在生醫文獻中,透過建構自動化的文獻資料處理流程,從巨量的生醫文獻擷取出各疾病相關的生物標誌(biomarker)。第二部分將專注介紹社群媒體的文字探勘技術以及目前最熱門的深度學習應用於社群媒體探勘,並帶領學員跟著分析流程實際操作。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20171017.php (公佈日期:2017-09-21)
   
本核心設施在新世代生物資訊分析豐富的實戰經驗與所建置的分析平台,提供基礎理論、實際應用到進階實機操作。讓研究者於日後面對基因體數據需進行分析及其產生之數據,不再一籌莫展無所適從。此次研習會主要為「功能性基因體分析」與「微生物基因體分析」兩大主題,以簡明的方式讓學員們快速熟悉各種相?鷏禤おw及研究平台的使用。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop.php#d17 (公佈日期:2017-09-21)
   
為便利各地學者能就近參與生物資訊分析實務課程,本次研習會將於台南成功大學與北部清華大學各舉辦一場,期望此研習會能提供基因體與蛋白質結構之相關領域研究的人員及學生在實驗數據分析上之助益,歡迎對生物資訊分析有興趣的師生踴躍參加。本研習會以本核心所開發或建置的基因體分析與生物資訊網路工具為主,所有課程均搭配電腦實地操作,課程包括「基因體分析系列」與「蛋白質結構生物資訊分析與應用」等兩大主題,以簡明的方式讓學員們快速熟悉各種相關資料庫及研究平台的使用。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20170810.php (公佈日期:2017-07-19)
   
國家衛生研究院辦理「高通量資料分析研習會:以基因體甲基化資料分?R為例」,自即日起開放報名!
本次研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)特性所提供之特殊機會,來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。基因體甲基化是表觀遺傳學(epigenetics)研究的重要一環,是在研究DNA序列不改變的情況下,DNA甲基化修飾與基因表達變化或細胞性狀(phenotype)改變之關係與機轉?C目前已知癌症形成與惡化、胚胎發育、老化過程,或是環境暴露、藥物反應等,均與基因體甲基化有著密切的關係。本次課程將以研究者常用之主流平台之一:Illumina的DNA methylation array之數據分析為例,介紹此類基因體甲基化實驗所得高通量數據之特性,分享如何著重再現性、統計推論、以及生物路徑解釋的分析經驗與心得。課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20170714.php (公佈日期:2017-06-29)
   
國家衛生研究院辦理「健康科學大數據分析研習會」,自即日起開放報名。
大數據分析是當今及未來健康科學中最重要及最經常性的工作。為幫助健康科學研究人員掌握大數據分析的基本觀念,本院生醫資源中心特舉辦「健康科學大數據分析研習會」。一般認為大數據指的是data Volume大,處理data的Velocity快,所利用的data Variety大,分析所得到結果的Veracity高,也就是所謂的4V。我們將以四個健康科學的研究工作具體呈現大數據分析的特性,歡迎對大數據有興趣的研究同好踴躍參加!課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://w3.nhri.org.tw/rr2016/index.html (公佈日期:2016-12-14)
   
國家衛生研究院辦理「基因體數據分析研習會」,自即日起開放報名。?賑※坌陛u轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設?I」舉辦之電腦實機操作研習會,希望能有效交流目前在定序技術分析的經驗與開發好的分析平台,來加速海量數據分析這個領域的研究能量。內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加!課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course2016032930.php (公佈日期:2016-03-22)
   
國家衛生研究院辦理「癌症基因體高通量數據分析研習會」,自即日起開放報名。本活動為「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」舉辦之電腦實機操作研習會,將以基因表現資料為主要素材,介紹(1) UCSC Genome Browser,(2)基因體高通量數據分析之前處理,(3)公用資料庫之中大量基因表現數據之利用,及(4)GSEA生物路徑分析法,內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加!課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20160316.php (公佈日期:2016-03-09)
   
[new]Biomedical text-mining 研習會報名即將截止!
自然語言處理在生醫文獻上之應用研習會,是由TBI Core Facility中研院資訊所許聞廉教授團隊所開發的生醫文獻?敦?biomedical text-mining)工具及分析方法,並帶領學員搭配電腦實際操作,讓學員們瞭解生醫文獻探勘的基礎流程,相信對您日常需要的literature search很有幫助,機會難得,請踴躍參加!

線上報名: http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php
研習會網址:http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20160129A.php (公佈日期 2016/01/26)
   
國家衛生研究院辦理「自然語言處理在生醫文獻上之應用研習會」與「MicroRNA生物資訊分析研習會」,自即日起開放報名。本活動為「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」舉辦之電腦實機操作研習會。自然語言處理研習課程將由中研院許聞廉教授的團隊介紹目前在生醫文獻探勘領域有許多相關的研究主題,研究人員必須面對到的資料格式都是屬於非結構化的文字敘述,Biomedical semantic role labeling 是可能的解法之一,本課程將依序介紹本核心TBI Core Facility所開發的Biomedical semantic role labeling工具及分析方法,並帶領學員跟著分析流程搭配電腦實地操作,讓學員們快速瞭解自然語言處理的基礎流程;MicroRNA研習課程將由交通大學黃憲達教授的團隊綜觀生物資訊整合分析而有重大發現或突破,並講解與上機實習重要的資料庫和分析工具。
此次訓練課程期望研究人員都能就藉由本核心所開發的分析工具,應用至自己的研究主題中達到事半功倍的效果。內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加!課程詳細內容與報名資訊,請參考網頁說明:http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php (公佈日期 2016/01/18)
   
國家衛生研究院辦理「結構生物資訊研習會」,自即日起開放報名。本?※坌陛u轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」舉辦之電腦實機操作研習會,以實例讓學員們快速熟悉蛋白質基礎結構,搭配3D結構視覺化軟體實地操作,提供學員系統性的概念與操作學習,有助於探討目標蛋白質結構相關的功能特性,內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加!課程詳細內容與資訊,請參考網頁說明:
http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20151229.php
本課程為2015研究資源系列活動之一,報名請至:
http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php (公佈日期 2015/12/14)
   
國家衛生研究院辦理「基因體研習會」,自即日起開放報名。
本活動為「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」舉辦之電腦實機操作研習會,將對微生物的基因體分析做一系列完整的介紹、MOLAS分析平台及實驗室電子紀錄本工具的操作與解說,內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加!課程?埴茪漁e與資訊,請參考網頁說明:http://www.tbi.org.tw/education/workshop/course20151117.php
本課程為2015研究資源系列活動之一,報名請至: http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php (公佈日期 2015/11/02)
   
2014 Frontiers in Genomic Research 國際研討會將於 2014/12/01~2014/12/05於國立成功大學舉行,其中12/3~12/5為「海量數據分析實務研習會」,並有電腦實習課程,詳細資訊請至 http://www.binfo.ncku.edu.tw/2014_FGR/,歡迎報名參加! (公佈日期 2014/11/14)
   
國家衛生研究院2014研究資源系列活動,自即日起開放報名。本活動特別與「台灣生物資訊核心設施」合作,舉辦電腦實機操作研習會,主題包括結構生物資訊、基因體分析、次世代序列分析與組裝、高通量資料分析等,內容豐富實用,歡迎踴躍報名參加! 課程詳細內容與資訊,請參考網頁說明:http://w3.nhri.org.tw/rr2014/
線上報名:http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php (公佈日期 2014/08/26)
   
第十三屆亞太生物資訊國際研討會(Asia-Pacific Bioinformatics Conference,APBC 2015) 將於 2015/01/21-2015/01/23 於新竹交通大學舉行。大會自即日起至2014/7/30止徵求生物資訊相關領域之論文,歡迎踴躍投稿!研討會網站及投稿方式請見:http://apbc2015.mbc.nctu.edu.tw/。 (公佈日期 2014/04/24)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第一季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2014/04/18)
   
TBI Core Facility 電子報」第8期出刊,本期內容為 "次世代基因體定序資料分析之序列組裝整合工具",歡迎點閱! (公佈日期 2014/04/16)
   
「2014系統生物與生物資訊研討會」(2014 Systems Biology and Bioinformatics Symposium, SBBS) 將在 2014/2/20於「國立清華大學生命科學二館B1華生講堂」舉辦。研討會主題包括:基因體研究、NGS的應用及結構生物資訊學,並於2/21舉辦RNA分析研習會,內容精彩可期,歡迎報名?悒[!活動網站及報名方法,請見:http://www.tbsb.org.tw/(公佈日期 (2014/02/12)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第?|季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2014/01/21)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第三季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2013/10/16)
   
TBI Core Facility 電子報」第7期出刊,本期內容為 "MicroRNA資料分析客製化服務",歡迎點閱! (公佈日期 2013/10/16)
   
「基因體分析研習會」「高通量資料分析研習會」,將在 9/6、9/11 於「國立成功大學」及「國家衛生研究院」舉辦,課程內容及線上報名請參考網頁資訊!(公佈日期 2013/08/23)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第二季更新!詳細內容請見網?飩〝?/a>!(公佈日期 (2013/07/29)
   
2013 年6月26 -28日於「國立清華大學生命科學二館電腦教室」舉辦,「台灣生物資訊核心設施研習會」錄影已上線,歡迎觀賞。(公佈日期 2013/07/25)
   
台灣生物資訊核心設施研習會」將在 6/26-6/28 於「國立清華大學生命科學二館電?ㄠ衎ョv舉辦,分為三場:(一) 結構生物資訊學研習會、(二) 高通量資料分析研習會、(三)基因體分析研習會,歡迎報名參加!課程內容及線上報名請參考網頁資訊!(公佈日期 2013/06/13)
   
TBI Core Facility 電子報」第6期出刊,本期內容為 "RNAi分析工具與服務",歡迎點閱! (公佈日期 2013/05/10)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第一季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2013/04/10)
   
TBI Core Facility 電子報」第5期出刊,本期內容為 "蛋白質結構分析服務及CPred分析工具介紹",歡迎點閱! (公佈日期 2013/02/26)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第 四季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2013/01/25)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第 三季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2012/10/19)
   
TBI Core Facility 電子報」第4期出刊,本期內容為 "建構以基因為基礎的重複性序列資料庫:Gene-based repetitive element database; GBRED",歡迎點閱! (公佈?暾?2012/09/14)
   
基因體分析研習會」,將?b 09/12 舉辦,歡迎報名參加!詳細內容請參考網頁資訊!(公佈日期 2012/08/24)
   
TBI Core Facility 電子報」第三期出刊,本期內容為 "GMESiRV: 全基因規模之代謝網路建構、模擬與視覺化平台",歡迎?I閱! (公佈日期 2012/07/09)
   
基因體分析研習會」,將在 07/19、20 於「國立成功大學醫圖電腦教室」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網頁資訊!(公佈日期 2012/07/06)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第 二 季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2012/07/02)
   
「miRNA分析研習會」「結構生物資訊學研習會」,將在 6/26及6/27於「中國醫藥大學互助大樓 7樓 第一電腦教室」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網頁資訊!(公佈日期 2012/06/11)
   
國家衛生研究院 EMBOSS ?尷R工具資料庫第一季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2012/04/27)
   
TBI Core Facility 電子報」第二期出刊,本期內容為 TBI - microRNA分析工具,歡迎點閱! (公佈日期 2011/12/30)
   
TBI台灣生物資訊核心設施將於 2011?~11月17日假國家衛生研究院統一健康大樓何曼德講堂舉辦「前瞻性轉譯醫學研討會-個人化醫療新紀元」, 研討會邀請國內外產學界專家,介紹個人化分子檢驗之研究與發展以及個人化醫療之?{床應用相關議題,精彩可期,歡迎報名參加! (公佈日期 2011/11/02)
   
TBI核心設施將於100 年 11 月 9 日 (星期三, 整天) - 11 月10 日 (星期四, 上午)於清華大學生命科學二館 B1 華生講堂(演講廳)舉辦 「2011 Systems Biology and Bioinformatics Symposium」, 本次研討會主題包括:系統生物學技術最新發展、高通量測序技術發展及應用、結構生物學研究、分子演化與疾病等,講員均為一時之選,包括李文雄院士、Prof. Justin Lamb, Prof. Sophia Y. Tsai 及多位專精於生物資訊與系統生物學領域的研究學者, 內容豐富精彩,歡迎大家共襄盛舉!本次研討會全程採用英文,詳細議程及報名資訊敬請參考研討會網頁:http://www.tbsb.org.tw/2011sbbs/ (公佈日期 2011/10/28)
   
TBI Core Facility 電子報」第一期出刊,本期內容為 TBI Core Facility 客製化資料分析服務簡介,歡迎點閱! (公佈日期 2011/09/30)
   
敬邀參加生技類核心設施平台維運計畫核心設施服務說明會,北區I場次將於100年9月29日(星期四)於國家衛生研究院:研究大樓B1, R1-1122會議室(苗栗縣竹南鎮科研路35號)舉行,歡迎踴躍參加!(公佈日期 (2011/09/28)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第三季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2011/09/02)
   
台灣生物資訊核心設施-客製化服務」,申請表下載-PDF檔  Word檔! (公佈日期 2011/08/29)
   
基因體分析研習會」,學員名單公佈!內容請參考網頁資訊!  (公佈日期 2011/08/24)
   
結構生物資訊學研習會」,將在 04/26 於「資策會資訊技術研究中心」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網頁資訊! (公佈日期 2011/04/18)
   
基因體註解與轉錄調控分析研習會」,學員名單公佈!內容請參考網頁資訊! (公佈日期 2011/04/18)
   
GMBD Bioinformatics Core 電子報」第八期出刊,本期內容為 "高通量定序小RNA整合性分析平台 (DSAP)" 分析工具介紹,歡迎點閱! (公佈日期 2011/04/15)
   
基因體註解與轉錄調控分析研習會」,將在 04/22 於「國家衛生研究院竹南院區圖資大樓5F電腦教室」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網?飧穈T! (公佈日期 2011/04/08)
   
國家衛生研究院 EMBOSS 分析工具資料庫第一季更新!詳細內容請見網頁說明!(公佈日期 (2011/03/08)
   
親緣演化分析研習?|」,將在 03/21-22 於「國立成功大學資訊大樓2樓 75209 電腦教室」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網頁資訊! (公佈日期 2011/03/03)
   
親緣演化分析研習會」?A將在 11/22-23 於「台灣師範大學進修推廣學院B1電腦教室 」舉辦,歡迎報名參加!課程內容請參考網頁資訊! (公佈日期 2010/11/02)
   
GMBD Bioinformatics Core 電子報」第七期出刊,本期內容為 "教育訓練課程介紹 -- GWAS 課程規劃",歡迎點閱! (公佈日期 2010/10/18)
   
2010 System Biology and Bioinformatics Symposium (SBBS)」,將在 11/04-06 於「國立清華大學生命科學二館 B1 華生?膩鞳v舉辦,主題包括:高通量測序技術發展及應用、系統生物學技術發展、結構生物學研究及生物資訊技術在演化及疾病等方面等研究,內容精彩可期,歡迎報名參加!詳細資訊請參考研討會網頁: http://www.tbsb.org.tw/sbbs/ (公佈日期 2010/10/14)

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