回首頁
站內搜尋
GCG
EMBOSS
PDA
Discussion group
Site Map
TBI Core
 
 

EMBOSS
國家衛生研究院 EMBOSS 服務
帳號申請Command Mode EMBOSSJEMBOSSEMBOSS GUI


為提供更完整的生物資訊工具,國家衛生研究院特別架設 EMBOSS 服務網站,供研究人員就近使用EMBOSS 100多個序列分析程式。

EMBOSS 簡介
  EMBOSS 全名為 European Molecular Biology Open Software Suite,是免費公開的序列分析用程式組,由分子生物研究社群所共同開發,其程式與世界蛋白質、核酸資料庫連結,並同步更新,除可用來搜尋序列、進行序列比對、尋找蛋白質motif、domain、二級結構等分析外,EMBOSS程式碼完全公開,且其核心程式基本設計為與各種開發平台相容,可以供研究人員作為開發應用程式的平台,世界各不同機構也因此開發了各種EMBOSS使用介面,目前國衛院安裝的是常用的JEMBOSS, unix command mode EMBOSS,以及Luke's EMBOSS GUI。
 
一、JEMBOSS
JEMBOSS 全名為 Java-EMBOSS,即 Java 介面的 EMBOSS 程式圖形使用介面,為英國的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所開發,採用 user-friendly 的 Java 視窗執行 EMBOSS 程式,並加入檔案管理功能,使用者 download Java 執行程式後,即可在自己的 PC 執行 emboss 程式並儲存分析結果,使用方便。
 
二、Command Mode EMBOSS
在 Unix 系統執行 EMBOSS,對熟悉Unix指令的是用者而言,程式執行十分快速。其核心程式亦由英國的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 開發,目前由 Sourceforge.net 負責維護更新。
 
三、EMBOSS GUI
由 Luke McCarthy (Plant Biotechnology Institute, National Research Council of Canada, (http://bioinfo.pbi.nrc.ca/) 所開發出來的網路介面,並且持續維護更新,將常用的EMBOSS程式整理分類,撰寫簡潔的網路介面 ,供使用者以網路瀏覽器操作 EMBOSS程式,很受學界歡迎。原站位於 http://www.cbr.nrc.ca/EMBOSS
 
聯絡資料:
服務信箱:bioinfo@nhri.org.tw
服務電話:037-246166 李桂玉 - 分機 33615
    汪詩海 - 分機 33629
    王旭川 - 分機 33617
系統維護: 盧培育 - 分機 33638

      竹南院區/苗栗縣竹南鎮 350 科研路 35 號     南港院區/台北市南港區115研究院路二段128號

      Copyright © National Health Research Institutes. All rights reserved.