TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位 國家衛生研究院
合辦單位 私立中國醫藥大學
國科會基因體醫學國家型科技計畫

blueball 簡   介

TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨 。 為 普 及 JEMBOSS 分 析 工 具 的 使 用 , 本 計 畫 特 與 中 國 醫 藥 大 學 合 作 , 開 設 JEMBOSS 基 礎 課 程 。 JEMBOSS 全 名 為 Java-EMBOSS,即 Java 介 面 的 EMBOSS 程 式 圖 形 使 用 介 面 , 為 英 國 的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所 開 發 並 持 續 維 護 更 新 , 採 用 user-friendly 的 Java 視 窗 執 行 EMBOSS 程 式 , 並 加 入 檔 案 管 理 功 能 , 使 用 者 download Java we start 執 行 程 式 後 , 即 可 在 自 己 的 PC 操 作 JEMBOSS 並 儲 存 分 析 結 果 , 使 用 方 便 。 本 課 程 將 介 紹 網 路 資 源 、 常 用 JEMBOSS 軟 體 之 原 理 和 使 用 方 法 介 紹 , 並 提 供 電 腦 實 作 , 讓 使 用 者 能 更 在 課 程 結 束 後 順 利 使 用 JEMBOSS 進 行 序 列 分 析 的 工 作 。 本 課 程 為 最 基 礎 之 課 程 , 適 合 初 學 序 列 分 析 者

[ 國衛院生物資訊服務 ]  [ EMBOSS服務簡介 ]  

blueball 課 程 時 間

時 間/地 點:
十月二十一日 (週二)中國醫藥大學立夫教學大樓103教室
十月二十二日 (週三)中國醫藥大學互助大樓 7F第一電腦教室
台中市學士路91號 [學校位置] ; [教室位置]

上課人數:

十月二十一日 (週二) JEMBOSS程式簡介 90 人
十月二十二日 (週三) JEMBOSS程式電腦操作 35 人

報 名 費 : 免 費

講 員 :國家衛生研究院 資訊組 李桂玉女士、翁翊嵐 先生 、汪詩海先生
時   間
內    容
92年10月21日 (週二)

15:10 - 17:30

  • 課程簡介(李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作(汪詩海)
  • 資料庫及EMBOSS程式簡介wossname, seqret(汪詩海)
  • 序列比對分析基本概念(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介needle, water, emma, showalign, prettyplot(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf(翁翊嵐)

  • 時   間
    內    容
    92年10月22日 (週三)

    9:30 - 16:30

  • EMBOSS GUI以及JEMBOSS使用介面(汪詩海)
  • 安裝Java Web Start, wossname, seqret程式練習(汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI(李桂玉)
  • 資料庫搜尋比對BLAST(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式練習needle, water, emma, showalign, prettyplot(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式練習remap, getorf, plotorf(翁翊嵐)
  • blueball 報 名 方 式 及 注 意 事 項
    1. 一 律 線 上 報 名 ,報 名 網 頁 請 見 http://infoserv.nhri.org.tw/apply_form.asp 92 年 10 月 9 日 報 名 截 止 以 中 部 地 區 學 員 優 先 。 由 於 座 位 有 限 , 如 報 名 人 數 過 多 , 本 院 保 留 篩 選 學 員 之 權 利 。

    2. JEMBOSS 課 程 資 料 庫 簡 介 、 序 列 分 析 程 式 原 理 等 內 容 與 SeqWeb 課 程 相 近 , 建 議 上 過 91 年 度 GCG 、 SeqWeb 課 程 者 先 參 照 JEMBOSS 使 用 說 明 試 行 操 作 後 再 決 定 是 否 需 要 參 加 本 課 程 。

    3. 上 課 名 單 將 於 課 程 開 始 前 一 週 公 布 於 本 網 頁 , 並 以 e-mail 通 知 , 請 務 必 提 供 正 確 的 e-mail ,謝 謝!

    4. 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐

    blueball 洽 詢 方 式

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    Last updated 2003/10/01