TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位 國家衛生研究院
合辦單位 私立中國醫藥大學
國科會基因體醫學國家型科技計畫

學員名單公告:程式簡介,電腦實習

blueball 簡   介

TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨 。 為 普 及 JEMBOSS 分 析 工 具 的 使 用 , 本 計 畫 特 與 中 國 醫 藥 大 學 合 作 , 開 設 JEMBOSS 基 礎 課 程 。 JEMBOSS 全 名 為 Java-EMBOSS,即 Java 介 面 的 EMBOSS 程 式 圖 形 使 用 介 面 , 為 英 國 的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所 開 發 並 持 續 維 護 更 新 , 採 用 user-friendly 的 Java 視 窗 執 行 EMBOSS 程 式 , 並 加 入 檔 案 管 理 功 能 , 使 用 者 download Java we start 執 行 程 式 後 , 即 可 在 自 己 的 PC 操 作 JEMBOSS 並 儲 存 分 析 結 果 , 使 用 方 便 。 本 課 程 將 介 紹 網 路 資 源 、 常 用 JEMBOSS 軟 體 之 原 理 和 使 用 方 法 介 紹 , 並 提 供 電 腦 實 作 , 讓 使 用 者 能 更 在 課 程 結 束 後 順 利 使 用 JEMBOSS 進 行 序 列 分 析 的 工 作 。 本 課 程 為 最 基 礎 之 課 程 , 適 合 初 學 序 列 分 析 者

[ 國衛院生物資訊服務 ]  [ EMBOSS服務簡介 ]  

blueball 課 程 時 間

時 間/地 點:
十月二十一日 (週二)中國醫藥大學立夫教學大樓103教室
十月二十二日 (週三)中國醫藥大學互助大樓 7F第一電腦教室
台中市學士路91號 [學校位置] ; [教室位置]

上課人數:

十月二十一日 (週二) JEMBOSS程式簡介 90 人
十月二十二日 (週三) JEMBOSS程式電腦操作 40人

報 名 費 : 免 費

講 員 :國家衛生研究院 資訊組 李桂玉女士、翁翊嵐 先生 、汪詩海先生
時   間
內    容
92年10月21日 (週二)

15:10 - 17:30

  • 課程簡介(李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作(汪詩海)
  • 資料庫及EMBOSS程式簡介wossname, seqret(汪詩海)
  • 序列比對分析基本概念(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介needle, water, emma, showalign, prettyplot(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf(翁翊嵐)

  • 時   間
    內    容
    92年10月22日 (週三)

    9:30 - 16:30

  • EMBOSS GUI以及JEMBOSS使用介面(汪詩海)
  • 安裝Java Web Start, wossname, seqret程式練習(汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI(李桂玉)
  • 資料庫搜尋比對BLAST(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式練習needle, water, emma, showalign, prettyplot(李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式練習remap, getorf, plotorf(翁翊嵐)
  • blueball 上 課 注 意 事 項
    1. 本 課 程 以 E-mail 發 給 學 員 上 課 通 知,報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加 。 本 次 課 程 多 人 向 隅 , 若 無 法 來 上 課 , 請 儘 早 通 知 主 辦 單 位 , 以 便 將 機 會 讓 給 其 他 人 。

    2. 上 課 時 請 攜 帶 有 效 的 使 用 帳 號 (username 及 password )上 機 操 作 , 並 請 於 上 課 前 先 login, 測 試 是 否 有 任 何 問 題 。 若 無 帳 號 可 由 實 驗 室 主 持 人 提 出 帳 號 申 請

    3. 敬 請 準 時 報 到 , 以 避 免 影 響 課 程 之 進 行。

    4. 上 課 時 可 帶 一 些 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5 吋 磁 碟 片 中 , 長 度 請 勿 超 過 1kb 。

    5. 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 遵 守 上 課 場 所 的 相 關 規 定 。

    6. 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。

    blueball 學員名單

    10/21 JEMBOSS 程式簡介

    姓 名
    單  位
    職 稱
    姓 名
    單  位
    職 稱
    方世華
    中國醫藥大學
    副教授
    張綺芳
    中正大學
    博士生
    王孟珠
    中國醫藥學院
    研究生
    許一丰
    中山醫學大學
    碩士班學生
    王信文
    國立彰化師範大學
    助教授
    郭淑明
    台中健康暨管理學院
    碩一學生
    王昭華
    東海大學
    研究生
    陳仁元
    中國醫藥學院
    研究生
    王梅林
    中山醫學大學
    助理教授
    陳永洽
    逢甲大學化工研究所
    碩士生
    王薇猗
    中興大學
    學生
    陳冠伶
    中興大學
    學生
    江秀梅
    中國醫藥大學
    研究生
    陳茂榮
    中國醫藥大學
    研究生
    何露菁
    中國醫藥大學
    學生
    陳昶華
    彰化基督教醫院
    主治醫師
    余鍾苹
    中國醫藥大學
    專任助理
    陳師慶
    中國醫藥大學
    助教授
    吳明昇
    逢甲大學化工研究所
    碩士生
    陳詩雅
    中興大學
    學生
    吳恆祥
    中山醫學大學毒理所
    博士班生
    曾美菁
    中興大學
    學生
    吳漢威
    台中健康管理學院
    學生
    曾瑞堂
    農業藥物毒物試驗所
    技術工
    吳德威
    中山醫學大學
    碩士生
    曾靜宜
    臺中健康暨管理學院
    學生
    吳靜如
    中興大學
    博士
    游竣棠
    台中健康管理學院
    研究生
    李泰林
    大葉大學
    助理教授
    黃子彥
    中國醫藥大學
    學生
    李珮瑜
    中台醫護技術學院
    助理教授
    黃郁文
    中山醫學大學
    大學生
    李鳳琴
    中國醫藥大學
    副教授
    黃章文
    國立中興大學
    研究生
    李錦城
    中台醫護技術學院
    學生
    黃景堂
    中國醫藥大學
    研究生
    汪家銘
    雲林科技大學資工所
    研究生
    楊文仁
    農業藥物毒物試驗所
    專業助理
    周志雄
    逢甲大學化工研究所
    教授
    楊建洲
    中山醫學大學
    博士班學生
    周奎秀
    中山醫學大學
    研究生
    楊國泰
    國立中興大學
    博士生
    周映孜
    中興大學
    博士生
    楊婷婷
    中國醫藥大學
    助理教授
    林正宏
    中興大學
    副教授
    溫文綺
    中山醫學大學
    研究員
    林永立
    中興大學
    研究生
    詹雯玲
    中國醫藥大學附設醫院
    助理
    林佳譓
    中國醫藥學院醫學系
    學生
    靳子蓉
    農業藥物毒物試驗所
    助理研究員
    林奇勇
    彰化基督教醫院
    組長
    廖美惠
    中國醫藥大學
    研究助理
    林宗俊
    農業藥物毒物試驗所
    專業助理
    廖珮如
    中山醫學大學
    研究生
    林怡璇
    疾管局第三分局
    研究助理
    廖璿程
    衛生署疾病管制局
    研究助理
    林姿伶
    中興大學
    學生
    劉幸宜
    東海大學
    研究生
    林秋宏
    疾管局
    研究助理
    蔡佳芬
    台中區農業改良場
    研究助理
    林靜茹
    中國醫藥大學
    助理教授
    鄭如茜
    中國醫藥大學
    副教授
    邱少婷
    自然科學博物館
    副研究員
    鄭雅文
    中山醫學大學
    助理教授
    邱啟隆
    中興大學應用微生物
    研究生
    謝佩勳
    中國醫藥大學
    研究生
    侯鈺琪
    中國醫藥大學
    助理教授
    謝奉家
    農委會毒物試驗所
    助理研究員
    姚厚凡
    逢甲大學化工研究所
    碩士生
    謝賢書
    中興大學
    研究生
    洪娟娟
    國立中興大學
    學生
    鍾景光
    中國醫藥大學
    教授
    洪雄儒
    台中健康暨管理學院
    學生
    簡文斌
    中山醫學大學
    博士班學生
    夏偉中
    臺中健康暨管理學院
    學生
    簡孝誠
    中山醫學大學
    博士班學生
    夏麒盛
    中國醫藥學院
    研究生
    簡淑慧
    中國醫藥大學
    研究助理
    姬盈璋
    中國醫藥學院
    研究生
    簡華宏
    中國醫藥大學
    副教授
    徐正光
    中興大學
    研究助理
    魏士欽
    義守大學
    研究生
    翁巧玲
    逢甲大學化工研究所
    碩士生
    蘇旭梅
    國立中興大學
    學生
    張佑誠
    中山醫學大學
    研究助理
    蘇育平
    中興大學
    研究生
    張恆源
    中國醫藥大學
    博士班學生
    蘇柏栩
    中興大學
    研究生
    張若麟
    中興大學
    博士班學生
    蘇美蘭
    中華大學
    學生
    張淑貞
    中國醫藥大學
    副教授

    10/22 JEMBOSS 電腦實習

    姓 名
    單  位
    職 稱
    王梅林
    中山醫學大學
    助理教授
    余鍾苹
    中國醫藥大學
    專任助理
    吳靜如
    中興大學
    博士
    李珮瑜
    中台醫護技術學院
    助理教授
    李鳳琴
    中國醫藥大學
    副教授
    周映孜
    中興大學
    博士生
    林正宏
    中興大學
    副教授
    林奇勇
    彰化基督教醫院
    組長
    林怡璇
    疾管局第三分局
    研究助理
    林秋宏
    疾管局
    研究助理
    林詩芸
    中興大學
    博士生
    邱少婷
    國立自然科學博物館
    副研究員
    侯鈺琪
    中國醫藥大學
    助理教授
    夏麒盛
    中國醫藥大學
    研究生
    姬盈璋
    中國醫藥大學
    研究生
    張恆源
    中國醫藥大學
    博士班學生
    張若麟
    中興大學
    博士研究生
    張淑貞
    中國醫藥大學
    副教授
    張綺芳
    中正大學
    博士生
    郭淑明
    台中健康暨管理學院
    碩一學生
    陳仁元
    中國醫藥大學
    研究生
    陳昶華
    彰化基督教醫院
    主治醫師
    黃景堂
    中國醫藥大學
    研究生
    楊文仁
    農業藥物毒物試驗所
    專業助理
    楊建洲
    中山醫學大學
    博士班研究生
    楊國泰
    國立中興大學
    博士生
    楊婷婷
    中國醫藥大學
    助理教授
    溫文綺
    中山醫學大學
    研究員
    靳子蓉
    農業毒物試驗所
    助理研究員
    蔡佳芬
    台中區農業改良場
    研究助理
    鄭如茜
    中國醫藥大學
    副教授
    謝佩勳
    中國醫藥大學
    研究生
    謝奉家
    農委會毒物試驗所
    助理研究員
    謝賢書
    中興大學
    研究生
    劉幸宜
    東海大學
    研究生
    詹雯玲
    中國醫藥大學附設醫院
    助理
    周志雄
    逢甲大學化工研究所
    教授
    鍾景光
    中國醫藥大學
    教授
    陳師慶
    中國醫藥大學
    助教授
    林靜如
    中國醫藥大學
    助教授

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    Last updated 2003/10/15