TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 教 育 課 程

Phylogenetic Analysis Workshop

分子演化分析研習會

*** 學員錄取名單 ***

主辦單位 國家衛生研究院
合辦單位 國科會基因體醫學國家型科技計畫

blueball 課 程 簡 介

TBI 生 物 資 訊 學 核 心 整 合 計 畫 為 基 因 體 醫 學 國 家 型 科 技 計 畫 所 支 持 ,由 國 家 衛 生 研 究 院 研 究 資 源 處 執 行 , 以 提 供 並 推 廣 各 項 生 物 資 訊 服 務 為 宗 旨。為 普 及 分 子 演 化 分 析 工 具 之 使 用,本 計 畫 特 開 設 分 子 演 化 分 析 研 習 課 程。

自 基 因 體 定 序 計 畫 陸 續 進 行 後 , 以 不 同 物 種 的 同 一 基 因 序 列 分 析 而 定 出 各 物 種 間 之 演 化 關 係 的 分 子 演 化 分 析 , 越 來 越 受 到 不 同 領 域 的 研 究 人 員 的 重 視 。 這 類 演 化 分 析 除 程 式 的 實 際 操 作 之 外 , 若 能 了 解 其 分 析 理 論 基 礎 , 可 增 加 分 析 結 果 之 正 確 性 及 可 信 度 。

本 課 程 主 要 講 解 分 子 演 化 分 析 基 本 理 論、介 紹 常 用 之 分 子 演 化 分 析 軟 體, 並 配 合 電 腦 上 機 操 作,俾 使 學 員 對 分 子 演 化 分 析 能 有 更 進 一 步 的 了 解 。

blueball 課 程 時 間

時  間: 九十三年 十月二十一日 、 二十二日 (週四、五) 共 二 日

地  點: 中 研 院 生 圖 電 腦 教 室
      北 市 研 究 院 路 二 段 128 號 [地圖]
上課人數: 40 人

blueball 課 程 內 容

講 員 : 劉信孚  博士

馬偕紀念醫院 醫學研究部 副研究員

時   間 課 程 內 容
十月二十一日
9:00 - 10:30

Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetic Analysis

Phylogenetic Analysis Methods
Theoretical background of different phylogenetic methods,
Distance matrix methods, substitution models

10:45 - 12:00 Phylogenetic Analysis Methods
Distance matrix methods, substitution models
Lunch break
13:30 - 15:00 Computer Lab
Phylip home page, Genedoc (file conversion)
Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): distance matrix methods
15:15 - 17:00 Phylogenetic Analysis Methods
Discrete character methods (Parsimony method, Maximum likelihood method)
Computer Lab
Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): discrete character methods
十月二十二日
9:00 - 10:30

Statistical Test for Phylogenetic Trees

Computer Lab
PHYLIP: bootstrap analysis

10:45 - 12:00 The Other Phylogenetic Analysis Methods
Quartet puzzling method, Likelihood mapping analysis

Examples of Applications Using Phylogenetic Analysis

Lunch break
13:30 - 16:00 Detecting Recombination in Viral Sequences
Simplot

Computer Lab
TREE-PUZZLE, Fast-dnaml, MacClade, …etc.
Free practice and trouble shooting.


blueball 繳 費 及 上 課 注 意 事 項
  1. 報 名 資 格 請 勿 轉 讓 或 代 理 參 加 , 若 無 法 來 上 課 , 請 儘 早 通 知 主 辦 單 位 , 以 便 將 機 會 讓 給 其 他 人 。
  2. 圖 書 館 於 早 上 8:30 開 館 , 請 於 早 上 8:40-9:00 報 到 , 並 請 準 時 到 場 上 課 。
  3. 報到完成後,會發給上課證,請在上課期間妥善保存 。進出圖書館時,出示上課證 ,待館員將閘門打開後,從左手邊的閘門進出,切誤在閘門未開啟的情況下推擠閘門造成損壞。
  4. 上 課 時 可 帶 align 好 的 多 條 DNA 序 列 做 為 練 習 之 用 , 請 以 純 文 字 檔 存 在 3.5 吋 磁 碟 片 中。
  5. 上 課 時 請 勿 攜 帶 太 多 物 品 , 並 請 儘 量 將 包 包 放 在 圖 書 館 之 置 物 櫃 中 , 並 遵 守 圖 書 館 相 關 規 定 。
  6. 本 課 程 恕 不 供 應 午 餐 。

*** 課 程 名 單 ***

10/21、22 分子演化課程

姓名
單位
職稱
方紹威
藥物食品檢驗局
薦任技正
王文德
中研院
博士後研究員
王錫杰
衛生署疾病管制局
副研究員
朱翊維
交通大學
研究生
朱鴻鈞
台灣大學
研究生
江建宏
中研院
研究助理
何立勇
中研院
資訊人員
何國領
交通大學
博士生
余雪菁
台灣大學
學生
吳啟智
中研院
研究助理
李青芸
台灣大學
研究生
李國斌
中研院
碩士班研究生
林佳祺
中研院
研究助理
林秋芳
中央大學
助教
林茗儀
中原大學
研究生
林嘉衍
東海大學
研究生
侯亞芃
台灣大學
研究生
胡槿奕
中央大學
碩士班研究生
孫玉齡
中央大學
碩士班研究生
徐駿森
中研院
博士後研究員
袁秋英
藥物毒物試驗所
助研究員
張育彰
藥物食品檢驗局
薦任技士
張瑞仁
中興大學
研究生
張碧芳
中興大學
助理教授
許雅鈞
藥物食品檢驗局
技士
許維中
長庚大學
研究生
陳建先
大同大學
助理教授
陳雯怡
中原大學
研究生
陳靖玉
海洋大學
研究生
陳燕萍
農委會家畜衛生試驗所
助理研究員
曾淑慧
衛生署疾病管制局
分局長
黃中興
衛生署疾病管制局
薦任技士
黃柏蒼
台灣大學
博士班研究生
楊茱芳
中興大學
博士生
楊冀冬
交通大學
研究生
葉慈容
台灣大學
研究助理
詹珮君
台大醫院
醫師
劉育姍
台灣大學
博士班研究生
蕭樑材
台北榮民總醫院
主治醫師
錢文賢
警察大學
研究生
薛俐文
東吳大學
研究生
謝玉貞
藥物毒物試驗所
助理研究
簡嘉瑩
農業委員會畜產試驗所
助理研究員
顧芳祺
中山大學
研究生
龔紘毅
中研院
博士後研究

 

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Last updated 2004/10/15